Program Magister dengan Program Studi Ilmu Komputer yang dirintis pada tanggal 27 Agustus 2008 dengan izin penyelenggaraan No. 2858/D/T/2008. Program ini bertujuan untuk membantu STMIK Nusa Mandiri dalam merencanakan dan melaksanakan pendidikan jenjang Strata-2 secara mandiri.
Pembangunan bangsa Indonesia yang sedang dilakukan saat ini membutuhkan informasi dan pengelolaan data yang tepat, cepat dan akurat. Terlebih inovasi disruptif (disruptive innovation) tengah merajai dunia, salah satunya model bisnis start up yang komponen utamanya adalah teknologi informasi.
Untuk itu dibutuhkan capital human yang kreatif, inovatif dan handal pada bidang teknologi informasi serta komunikasi untuk menciptakan karya-karya hasil penelitian.
Kemandirian dan keberanian untuk menciptakan lapangan kerja yang berbasis teknologi informasi sangat dibutuhkan di tengah bergesernya tren pola bisnis di masyarakat.
Untuk itu program Magister STMIK Nusa Mandiri mengarahkan mahasiswa agar tidak hanya mahir serta kompeten pada bidangnya, namun juga dapat berinovasi, menganalisa dan menemukan solusi kreatif bagi permasalahan ataupun kebutuhan bisnis yang berorientasi terhadap kebutuhan masyarakat.
Melalui Program Studi Ilmu Komputer dengan peminatan Software Engineering , Data Mining dan Image Processing, dan diyakini akan mampu memberikan motivasi pada mahasiswa untuk melakukan inovasi disruptif.